신기한_바이오

miRNA 이름에 담긴 의미 [Nomenclature]

Oddientist 2022. 1. 19. 00:49

miRNA은 크게 3부분으로 이뤄져 있습니다. miRNA의 이름에 담긴 의미를 안다면 마이크로 RNA의 종(species), 생성과 기원을 이해하는데 도움이 됩니다.


ㅑmiRNA_이름_구조

miRNA Nomenclature

 

 

1) mir-123은 먼저 발견되는 순으로 정해진다. mir-123은 mir-456보다 빨리 발견된 것이다.

2) "mir-"는 전구체인 pre-miRNA를 의미하며, "miR-" 완성된 mature form을 갖는 microRNA를 의미합니다.

 

3) a or b : 한두개 뉴클레오타이드를 제외하고 거의 대부분의 sequence가 동일한 miRNA다. miR-123a와 miR-123b은 매우 유사하다. 차이가 나는 뉴클레오타이드는 <seed region>이 아닌 부분이다.

 

4) -1,-2: mature miRNA는 100% 동일한 sequence를 갖지만 생성된 유전자의 위치는 다른 miRNA를 구분할 때 사용된다. 예를 들어, pre-miRNAs hsa-mir-194-1과 hsa-mir-194-2는 동일한 mature miRNA (hsa-miR-194)를 만들지만 만들어진 genome은 다르다.

 

5) 종에 따른 명명: miRNA의 이름 맨 앞부분은 species에 따라 3글자로 표기된다. 예를 들어, hsa-miR-123은 사람(homo sapiens)의 miRNA를 말하며, oar-miR-123은 sheep (Ovis aries)miRNA를 나타낸다.

 

6) Mature miRNA는 두가닥의 pri-miRNA로 부터 생성되는데, sense strand-3p, antisense strand-5p로 표기한다.

 

7)"*" : asterisk는 hairpin miR-123과 상보적인 가닥인 miR-123*에서 발현량이 낮은 것을 의미한다. 보통 한쪽은 degradation되어 세포내 양이 적다.

miRNA_nomenclature

 


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