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안녕하세요! 바이오 블로그에 오신 것을 환영합니다. 여러분은 혹시 차세대 염기서열 분석(NGS)에 대해 얼마나 알고 계신가요? NGS는 생명 과학 연구의 판도를 바꾼 혁신적인 기술이지만, 그 복잡한 과정 때문에 많은 분들이 어려움을 느끼시곤 합니다. 특히 NGS 라이브러리 제작은 성공적인 분석을 위한 핵심 단계로, 여기서의 작은 실수 하나가 전체 실험을 망칠 수도 있습니다. 그래서 오늘은 NGS 라이브러리 제작의 두 가지 핵심 요소인 DNA 조각화(fragmentation)와 PCR 사이클 최적화에 대해 자세히 알아보는 시간을 가질 거예요. 이 글을 통해 여러분의 NGS 실험이 한 단계 더 성공적으로 진행될 수 있도록, 제가 가진 모든 노하우를 아낌없이 풀어놓겠습니다. 자, 그럼 시작해볼까요?NGS 시퀀..

20~25nt 짧은 RNA도 캡핑 가능할까? Vaccinia Capping Enzyme과 정제방법 총정리Short RNA, 예를 들어 20~25nt 길이의 RNA도 cap 구조를 부여할 수 있을까요? 많은 연구자들이 Vaccinia Capping Enzyme (NEB #M2080)을 활용한 Cap-0 합성을 계획할 때 가장 먼저 마주치는 고민입니다. 특히 in vitro transcription으로 합성된 짧은 RNA에 cap을 부여하려는 경우, 효소가 작동할지, 정제는 어떻게 해야 할지 명확한 정보가 부족하기 때문이죠.오늘은 이 질문에 명확한 답을 드리기 위해, NEB의 가이드라인과 함께 효율적인 짧은 RNA의 캡핑 조건 및 정제 방법까지 정리해 드리겠습니다. Vaccinia Capping Enzyme..

BCA, Bradford, Quant-iT™부터 형광 기반까지 바이오의약품 분석의 핵심 가이드바이오의약품 개발에서 단백질 정량(protein quantitation)은 품질 관리와 기능 분석의 출발점입니다. 하지만 단백질의 종류나 수정 여부(예: PEGylation, Glycosylation)에 따라 정량 결과가 달라질 수 있어, 어떤 정량법을 선택하느냐에 따라 데이터의 신뢰도가 크게 바뀝니다.오늘은 "A Comparison of Protein Quantitation Assays for Biopharmaceutical Applications" 논문을 바탕으로 6가지 대표적인 단백질 정량법(BCA, Bradford, CBQCA™, DC, Fluorescamine, Quant-iT™)의 장단점과 바이오의약품..

Q5 Site-Directed Mutagenesis Kit란?안녕하세요, 여러분! 오늘은 Q5 Site-Directed Mutagenesis Kit를 활용해 플라스미드에 원하는 변이를 손쉽게 도입하는 방법에 대해 알아보겠습니다. SDM은 유전자 기능 연구나 단백질 구조·기능 분석에 필수적인 기법인데요, Q5 Kit를 쓰면 복잡한 과정을 간편하게 수행할 수 있습니다.주요 특징Substitutions, Deletions, Insertions 모두 가능짧은 플라스미드에 최적화돼 높은 효율 보장KLD (Kinase, Ligase, DpnI) 반응으로 간편한 리서큘러라이제이션Q5 SDM Kit는 플라스미드의 특정 염기서열을 삽입·치환·제거할 때 사용하는 키트로, KLD 반응을 통해 간편한 circularizati..

소개LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification) 실험을 준비하면서 여러 가지 검출 방법 때문에 고민해본 적 있으신가요? 진단 검사나 연구 프로젝트를 진행할 때, 적합한 LAMP 키트와 검출 방식을 선택하는 것이 신뢰할 수 있는 결과를 얻기 위해 매우 중요합니다. 이 가이드에서는 NEB의 WarmStart® LAMP 제품군—pH 기반의 컬러리메트릭(Colorimetric) 믹스부터 형광 검출 키트까지—의 모든 것을 설명하고, 프라이머, 염료, 대체 판독 방법에 대한 자주 묻는 질문에도 답변해 드립니다. 그럼 시작해볼까요?1. LAMP 이해하기: 검출 방법이 중요한 이유어떤 LAMP 반응은 선명한 노란색으로 변하고, 어떤 반응은 형광 채널에서 반짝이는 이유가 궁금하셨나요..

Mastering Human and Bacterial rRNA Depletion with NEBNext KitsRNA-Seq나 메타트랜스크립토믹스와 같은 고감도 RNA 분석 실험에서는 **리보솜 RNA(rRNA)**가 차지하는 비율을 줄이는 것이 매우 중요합니다. 특히, 인간(human)과 박테리아(bacterial) rRNA를 동시에 제거해야 하는 경우가 흔한데요. 이 글에서는 NEBNext v2 rRNA Depletion Kit를 활용하여 human + bacterial rRNA를 한 번에 효율적으로 제거하는 방법과, species-specific custom probe 제작 방법을 쉽고 자세히 설명드리겠습니다.1. rRNA Depletion의 중요성많은 생체 시료에는 전체 RNA 중 rRNA가 80..

고감도 Whole Genome Amplification for Low-Input DNA몇 femtograms(fg) 수준의 DNA로 전체 게놈을 증폭할 수 있다는 사실이 믿기시나요? 여러분의 소중한 single-cell 샘플, 희귀 미생물, 혹은 고대 DNA를 다룰 때, Whole Genome Amplification(WGA)만이 downstream 분자 분석을 가능하게 합니다. 이 가이드에서는 NEB의 phi29-XT WGA Kit를 깊이 파헤치고, 핵심 기능, 최적 워크플로우, 그리고 debranching과 RNA 제거에 대한 실용적인 팁을 알려드립니다. 이 글을 읽고 나면, 단 10 fg의 입력 DNA로도 견고하고 고수율의 게놈 라이브러리를 생성할수 있을 것입니다.유전체학에서 WGA가 중요한 이유W..

🔬 PCR과 RT-PCR이란?**PCR (Polymerase Chain Reaction)**과 **RT-PCR (Reverse Transcription PCR)**은 현대 생명과학 실험에서 가장 기본이자 핵심이 되는 분자생물학 기술입니다. 감염 질환 진단, 유전자 클로닝, 유전체 연구까지—이 기술 없이 실험을 진행하는 건 상상할 수 없습니다.PCR은 DNA의 특정 구간을 수백만 배로 증폭시켜 분석과 조작을 가능하게 해줍니다. 반면 RT-PCR은 RNA로부터 cDNA를 합성한 후 이를 PCR로 증폭하는 방식으로, RNA 기반 분석에 매우 유용합니다.무엇보다 중요한 건 어떤 DNA polymerase를 선택하느냐입니다. 특히 Taq DNA Polymerase, proofreading 기능, OneTaq, ..

Site-Directed Mutagenesis 완벽 가이드소개Site-directed mutagenesis (SDM)는 DNA 염기서열에 특정한 변이를 도입할 수 있는 강력한 분자생물학 기술입니다. 이 기술은 유전자 기능, 단백질 구조, 효소 활성을 연구하는 데 매우 유용합니다. Site-Directed Mutagenesis란?사이트 지향 돌연변이는 DNA의 특정 염기를 의도적으로 바꾸어 단백질 서열에 변화를 주는 기술입니다. 무작위 돌연변이 유도법과는 달리, 정확하고 반복 가능한 결과를 얻을 수 있습니다.활용 분야단백질 공학: 안정성, 활성, 기질 특이성을 향상시키는 변이 도입기능 유전체학: 특정 돌연변이를 통해 유전자 기능 분석질병 모델링: 유전질환 관련 변이를 실험적으로 재현신약 개발: 단백질-약물..

Q5 Site-Directed MutagenesisSite-Directed Mutagenesis(SDM)는 플라스미드 DNA에 특정 변이를 도입할 수 있는 분자생물학의 핵심 기술입니다. 유전자 기능 연구, 단백질 구조 분석, 코돈 최적화 등에 활용되며, 정밀한 유전자 변형을 가능하게 합니다.Site-Directed Mutagenesis란?SDM은 플라스미드 내에서 뉴클레오티드의 삽입, 삭제 또는 치환을 가능하게 합니다. 주요 응용 분야:유전자 발현 연구단백질 구조/기능 분석번역 후 변형 연구전사 인자 결합 부위 조절제한 효소 인식 부위 생성/제거코돈 최적화Q5 Site-Directed Mutagenesis 키트(NEB #E0552)는 강력한 고정밀 PCR 기반 워크플로우로 이 과정을 쉽게 만들 수 있습니..