신기한_바이오 16

Site-Directed Mutagenesis를 만드는 간단한 방법

Q5 Site-Directed MutagenesisSite-Directed Mutagenesis(SDM)는 플라스미드 DNA에 특정 변이를 도입할 수 있는 분자생물학의 핵심 기술입니다. 유전자 기능 연구, 단백질 구조 분석, 코돈 최적화 등에 활용되며, 정밀한 유전자 변형을 가능하게 합니다.Site-Directed Mutagenesis란?SDM은 플라스미드 내에서 뉴클레오티드의 삽입, 삭제 또는 치환을 가능하게 합니다. 주요 응용 분야:유전자 발현 연구단백질 구조/기능 분석번역 후 변형 연구전사 인자 결합 부위 조절제한 효소 인식 부위 생성/제거코돈 최적화Q5 Site-Directed Mutagenesis 키트(NEB #E0552)는 강력한 고정밀 PCR 기반 워크플로우로 이 과정을 쉽게 만들 수 있습니..

신기한_바이오 2025.04.23

클로닝 워크플로우에서 라이게이션 반응을 위한 벡터와 인서트의 최적량

클로닝 워크플로우에서 라이게이션 반응을 위한 벡터와 인서트의 최적량클로닝은 분자생물학의 기본 기술이며, 라이게이션 반응을 올바르게 설정하는 것이 성공의 핵심입니다. 연구자들이 가장 자주 묻는 질문 중 하나는:"라이게이션 반응에 얼마나 많은 벡터와 인서트를 사용해야 하나요?"이에 대한 답은 DNA 단편의 크기, 벡터 대 인서트 비율, 라이게이션 효율 등 여러 요소에 따라 달라집니다. 이 가이드에서는 표준 권장사항을 자세히 설명하고 클로닝 워크플로우를 최적화하기 위한 단계별 접근법을 제공합니다.라이게이션 반응에서 질량보다 몰 비율이 중요한 이유라이게이션을 설정할 때, 많은 초보자들이 DNA의 질량(ng)에만 집중하고 분자 수(fmoles/pmoles)를 고려하지 않는 실수를 합니다. 왜 이것이 문제인지 설명..

신기한_바이오 2025.04.22

Q5 DNA Polymerase의 Polymerase 및 Exonuclease 활성

Q5 DNAP의 60~80°C에서의 High Fedelity DNA 증폭 메커니즘HiFi PCR에서 Q5 HiFi DNA 중합효소는 독보적인 성능을 자랑합니다. 그 비결은 바로 교정활동(proofreading), 특히 3'→5' 엑소뉴클레아제 기능에 있습니다. 일반적인 Taq 중합효소와 달리, Q5는 단순히 DNA를 합성할 뿐만 아니라 실시간으로 오류를 검수하고 수정합니다.그렇다면 이 메커니즘은 실제로 어떻게 작동할까요? 그리고 온도는 왜 이렇게 중요한 요소일까요? 자세히 알아보겠습니다.Q5의 이중 기능: 중합효소 vs 엑소뉴클레아제 활성중합효소 활성: 75°C에서 최적, 저온에서는 약화Q5는 75°C에서 가장 효율적으로 뉴클레오타이드를 DNA 사슬에 결합시킵니다. 그러나 온도를 60°C로 낮추면 중합효..

신기한_바이오 2025.04.18

qPCR를 위한 Primer Design 가이드라인

Guidelines for Primer Design and Tm Range Acceptable with the Luna qPCR Products 왜 프라이머 디자인이 qPCR 실험의 성패를 좌우할까? qPCR (quantitative PCR) 실험에서 프라이머 디자인(primer design)은 결과의 정확도와 효율성을 결정하는 가장 중요한 요소 중 하나입니다. 특히 Luna qPCR 제품을 사용할 때는 최적의 조건을 맞추기 위해 프라이머의 Tm (melting temperature)와 amplicon 길이를 신중하게 설계해야 합니다. 이 글에서는 Luna qPCR을 사용할 때 권장하는 프라이머 디자인 가이드라인, 최적 Tm 범위, cDNA synthesis 및 multiplex qPCR..

신기한_바이오 2025.04.11

E. coli Plasmid DNA 메틸화가 Restriction Enzyme에 미치는 효과

E. coli 플라스미드 DNA 메틸화 상태 검출 방법이론E. coli에서 플라스미드를 클로닝했는데 Restriction enzyme이 이상하게 작동하지 않았던 경험이 있나요? 보이지 않는 원인은 바로 DNA 메틸화—특히 Dam과 Dcm 메틸화효소에 의한 변형입니다. 이 효소들은 DNA에 메틸기를 추가해 일부 제한효소는 차단하지만 다른 효소들은 정상적으로 작동하게 합니다.그렇다면 메틸화 상태를 확인하려면 어떻게 해야 할까요? 이 가이드에서는 다음 내용을 다룹니다:실험실 검증된 3가지 방법으로 Dam/Dcm 메틸화 확인하기dam-dcm- 형질전환 세포 사용 시기진단 도구로 활용하는 메틸화 의존적 절단 (DpnI 처리 같은)실패한 효소 처리 문제 해결법메틸화 검사가 중요한 이유대부분의 실험실 E. coli ..

신기한_바이오 2025.04.09

키트없이 Golden Gate assembly - BsaI-HFv2, Esp3I, BsmBI-v2

키트 없이 홈브루 골든 게이트 클로닝: BsaI-HFv2, Esp3I, BsmBI-v2 효소 비율 최적화골든 게이트 어셈블리는 강력한 분자 클로닝 기술이지만, 상업용 키트는 비쌀 수 있습니다. 상업용 키트 없이도 고효율, 저배경 클로닝을 할 수 있는 방법을 알려드리겠습니다. 이 가이드에서는 BsaI-HFv2, Esp3I, BsmBI-v2 효소와 T4 ligase를 사용한 최적화 방법을 상세히 설명합니다. 골든 게이트 어셈블리에서 효소 비율이 중요한 이유골든 게이트는 BsaI-HFv2 같은 Type IIS 효소가 DNA를 자르고, T4 ligase가 다시 연결하는 과정으로 이루어집니다. 하지만 균형이 맞지 않으면 다음과 같은 문제가 발생합니다:불완전한 절단 (절단되지 않은 백본)높은 클론 backgroun..

신기한_바이오 2025.04.09

7월 1주차 바이오 제약 소식을 핵심만 정리해 드립니다

23년 7월 최신의 바이오, 제약 소식을 전해드립니다. 제목과 내용을 확인하시고 링크도 걸어두었으니 자세한 내용은 링크를 통해서 확인하시기 바랍니다. 언제든지 새로운 소식을 빨리 듣고 싶으시다면 이메일을 알려주시면 일주일에 한 번 정리해서 드리겠습니다. 콜대원', 개선된 제품으로 어린이 아세트아미노펜 부족 해결 모색 제형 개선: 대원제약이 리콜 문제 해결 및 상분리 방지를 위해 '콜대원 키즈펜'의 특성 변경 승인을 받았다. 시장 영향 및 시기: 식품의약품안전처의 제제 개선 승인을 기다리는 동안 개선된 제품의 재도입으로 어린이용 아세트아미노펜 부족 문제가 해결될 수 있습니다. 대안의 필요성: 리콜 이후 어린이 감기약의 대체재 부족과 공급 제한으로 업계와 소비자의 우려가 제기되고 있어 문제 해결의 중요성이 ..

신기한_바이오 2023.07.08

AI가 의료 혁신의 열쇠일까? 의료비 절약과 진료 품질 향상을 위한 AI의 진정한 가능성은 무엇인가?

AI를 이용한 의료분야에서 활용에 대한 연구가 나왔습니다. 다음처럼 간단하게 정리해봤습니다. 1. 경제정책연구센터(CEPR)는 의료 분야에서 AI 기술의 광범위한 채택으로 연간 2000억3600억 달러에 해당하는 510%의 의료 지출을 절약할 수 있다는 분석 결과를 제시했습니다. 2. 의료 분야에서 AI의 채택은 다른 산업에 비해 뒤쳐지고 있으며, 이는 의료 데이터의 분산과 개인 정보 보호 문제 등의 장벽으로 설명됩니다. 3. AI의 적용 영역으로는 치료 연속성, 예약 관리, 임상 운영 및 분석, 가치 기반 치료, 보험 청구 관리 등이 있습니다. 4. 저자들은 현재보다 더 광범위하게 AI를 도입하면 연간 600억~1200억 달러를 절약할 수 있다고 추산하고 있습니다. 5. AI의 활용을 통해 의료비를 절..

신기한_바이오 2023.06.12

테라젠바이오, 국내 최초 NGS 기반 코로나19 진단 및 변이체 판정 시스템 특허 획득

글로벌 유전체 분석 서비스 및 AI 기반 신약 개발기업 테라젠바이오(대표 황태순)가 국내 최초로 NGS(차세대 염기서열 분석) 기반 코로나 진단 및 변이체 판정 시스템 특허(출원번호: 10-2021-0154442)를 취득했다. 기존 진단 방식 한계를 극복하는 혁신적인 시스템 회사에 따르면 해당 특허는 다양한 SARS-CoV-2 변이체를 동시에 진단할 수 있는 코로나바이러스 진단 시스템에 대한 것으로, 기존 PCR 진단방식의 한계를 보완하고 다양한 변이체를 동시에 감지할 수 있다는 장점을 지닌다. 기존의 DNA와 RNA를 분리, 핵산을 증폭해 질병을 진단하는 방식은 바이러스와 같이 변이가 잦은 질병의 경우에는 정확도가 떨어진다는 한계점이 있었다. 정확한 진단과 효율적인 전염병 관리를 위한 필수 기술 테라젠..

신기한_바이오 2023.06.01

동물실험에서 임상시험결과 도출 (From laboratory and animal studies to patients)

많은 연구자들이 궁금해합니다. 동물실험을 통해 미리 임상시험을 예측할 수 있을지 말입니다. 결론적으로 동물실험을 통해서 임상실험 결과를 직접적으로 예측할 수 없습니다. 간접적으로 "가능성 있겠는데?"정도입니다. 많은 연구자들도 궁금했던 것 같습니다. 논문을 통해서 비임상연구를 통해 임상연구를 예측할 수 있는지에 대한 리뷰 페이퍼가 많이 있습니다. 그중에 한 논문을 정리해서 이야기해보도록 하겠습니다. 1. The role of non-clinical studies 1.1. The role of non-clinical studies Clinical trials Risk management and mitigation New Drug Application (NDA) The prescription of a med..

신기한_바이오 2022.07.02
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